شناسایی پلی فازی Lechevaliera fradia subsp. Iranica، یک اکتینومایست نادر جدا شده از منطقه لوشان ایران

  مقدمه: اکتینومایست‏ها به طور وسیعی در محیط‏های طبیعی و ساخته دست بشر پراکنده شده‏اند و توانایی تجزیه مواد آلی را دارا هستند. همچنین، آن‏ها به عنوان یک منبع غنی برای تولید آنتی‏بیوتیک‏ها و مولکول‏های فعال زیستی شناخته می‏شوند و از اهمیت چشمگیری در صنعت برخوردار هستند .   مواد و روش ‏‏ ها: در این مطالعه، یک اکتینومایست نادر با نام LO5 جداسازی شد و تحت شناسایی پلی فازی قرار گرفت . این اکتینومایست نادر بر اساس دیدگاه تاکسونومی پلی فازی که به‏وسیله کمیته بین المللی سیستماتیک پروکاریوت‏ها (ICSP) مصوب شده است، شناسایی شد .   نتایج: دیواره سویه LO5 دارای دی‏آمینو پایملیک اسید نوع مزو یا دی (D) و همچنین، گالاکتوز، مانوز و رامنوز به‏عنوان قندهای تشخیصی است. محتوای فسفولیپیدی غشا شامل: دی فسفاتیدیل گلیسرول، فسفاتیدیل گلیسرول و فسفاتیدیل اتانول آمین است. تحلیل فیلوژنی بر اساس مقایسه توالی کامل ژن 16S rRNA نشان داد که این سویه از اعضای خانواده Pseudonocardiaceae و دارای شباهت 6/98 درصدی به Lechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T است. ارتباط DNA-DNA بین سویه LO5 و Lechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T گویای مقدار 75 درصدی است که با توجه به بالاتر بودن آن از حد 70 درصد که برای معرفی گونه‏های جدید به آن استناد می‏شود، سویه LO5 به عنوان زیرگونه Lechevalieria fradiae CGMCC 4.3506T با نام Lechevalieria fradiae subsp. Iranica IBRC-M 10378 معرفی می‏شود. بحث و نتیجه ‏ گیری: یک روش پلی فازی مبتنی بر مطالعات فنوتیپی، شیمیوتاکسونومی و فیلوژنی برای طبقه‏بندی یک اکتینومایست نادر در حد زیرگونه پیشنهاد شده است . برای به دست آوردن اطلاعات مورد نیاز برای تعیین وضعیت تاکسونومیک سویه LO5 ، از تکنیک‏هایی استفاده شده است که با حداقل استانداردهای لازم برای طبقه‏بندی یک میکروارگانیسم خاص که توسط زیرکمیته‏‏های تاکسونومی کمیته بین المللی سیستماتیک پروکاریوت‏ها تصویب شده اند، مطابقت دارند .